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抗击新冠巴斯夫超级计算机加入战队

时间:2022-05-19 来源网站:长乐市化工机械网

抗击新冠,巴斯夫超级计算机加入战队

作为#手护行动#的一部分,巴斯夫不仅捐赠了大量消毒剂和防护口罩,还在全球范围内为学术研究团体提供支持,帮助寻找合适的活性成分,用于治疗感染新冠肺炎的患者。

巴斯夫在行动

向科研团体免费开发包含数百万条目的物质库

超级计算机Quriosity助力全球性项目COVID Moonshot

巴斯夫生物科学研究平台总裁Peter Eckes博士:

“虽然我们没有药物活性成分研发业务,但巴斯夫在物质研究方面拥有超过150年的经验。这意味着我们拥有大量的相关知识和囊括多种活性成分的大型物质库中国机械网okmao.com。

巴斯夫拥有自己的超级计算机Quriosity,并开发了自己的计算机程序用于分子设计。此次巴斯夫充分发挥强大的研究能力,通过多种方式帮助寻找病毒解药,为抗击新冠疫情贡献一份力量。

为快速找到有效抑制新冠病毒的活性成分,世界各地的学术机构正通过细胞培养测试已批准的病毒类药物的有效性,虽然这些药物已用于治疗其他病毒性疾病,但可能对新冠病毒作用有限,因此还有必要寻找活性成分的改进衍生物。为此,巴斯夫研究人员对公司内部包含数百万种分子的物质库进行了计算机辅助搜索,以寻找类似的化合物,并最终确定了150种有希望的候选化合物。巴斯夫免费向各大学术工作团队提供这些化合物,并允许其用于研究,无需支付任何专利费。

巴斯夫生物科学研究员Matthias Witschel博士:

多年来,我们一直在支持疟疾等传染病的药物学术研究。因此,‘手’护行动才能迅速调用我们早已建立的人脉和流程。”

用Quriosity模拟活性分子

来自计算化学部的化学家们同时开始了另一条寻找活性成分的途径,即利用计算化学的知识帮助筛查活性组分。

他们得知一家生物技术公司PostEra正开展一项名为COVID Moonshot的项目,该项目通过来自全球的科学家志愿者寻找新冠病毒主蛋白酶的抑制剂,阻止病毒在人体内自我复制。巴斯夫研究人员也加入其中,共同寻找有效抑制剂,在巴斯夫内部开发的计算机程序和超级计算机Quriosity的帮助下设计出许多新型分子。

最终,他们通过计算机模拟找到了20个最适合主蛋白酶活性位点的分子,并将相关分子信息免费提供给该项目,作进一步研究。

巴斯夫数字生物科学研究部的计算化学主任Klaus-Jürgen Schleifer教授解释道:

然而,这些通过计算机模拟得来的分子,我们并不确定它们能否被准确合成。”

为此,巴斯夫研究人员也在尝试第三种寻找活性成分的方法:借助超级计算机,对一家COVID Moonshot项目的合约制造商理论上可以合成的所有化合物进行效能测试。可能的化合物多达约12亿种,巴斯夫团队就其抑制新冠病毒主蛋白酶的潜力进行一一计算。这种筛查方法的好处是,所有筛查下来的的活性分子都可以快速合成,然后在实验中接受测试。巴斯夫将通过COVID Moonshot项目公开这些结果。

Peter Eckes博士:

“非常高兴可以发挥我们在化学方面的特殊专长支持药物活性成分研究,并为学术研究团队提供真实和虚拟的活性分子。这或许有助于早日研发出抗新冠药物。

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